دوره 14، شماره 1 - ( بهار 1403 )
جلد 14 شماره 1 صفحات 12-1 |
برگشت به فهرست نسخه ها
Download citation:
BibTeX | RIS | EndNote | Medlars | ProCite | Reference Manager | RefWorks
Send citation to:
BibTeX | RIS | EndNote | Medlars | ProCite | Reference Manager | RefWorks
Send citation to:
Banaee M, Badr A A. Bioinformatic evaluation of the impact of miRNAs on the expression of detoxification-related genes in Zebrafish (Danio rerio). J. Aqua. Eco 2024; 14 (1) :1-12
URL: http://jae.hormozgan.ac.ir/article-1-1100-fa.html
URL: http://jae.hormozgan.ac.ir/article-1-1100-fa.html
بنایی مهدی، بدر احمد علی. ارزیابی بیوانفورماتیک تاثیر miRNAها بر بیان ژن‌های دخیل در فرآیند سم‌زدایی در گورخر ماهی (Danio rerio). مجله بوم شناسی آبزیان. 1403; 14 (1) :1-12
چکیده: (111 مشاهده)
گورخرماهی (Danio rerio) یک مدل ارزشمند برای مطالعه مکانیسم‌های مولکولی از جمله سم‌زدایی است. MicroRNA ها (miRNA)، مولکول های RNA غیر کد کننده کوچکی هستند که پس از رونویسی بیان ژن را تنظیم می¬کنند و به طور بالقوه بر شبکه پیچیده ژن های درگیر در مسیرهای سم زدایی تأثیر می گذارند. در این مطالعه، از تجزیه و تحلیل بیوانفورماتیک (Target Scan و پایگاه داده DIANA) برای بررسی نقش بالقوه miRNA ها در تعدیل و تنظیم بیان ژن‌های مرتبط با فرآیند سم‌زدایی در گورخرماهی استفاده شد. از طریق بررسی کامل مجموعه داده‌های miRNA و mRNA در گورخرماهی، miRNAهای کاندید پیش‌بینی شده برای هدف قرار دادن ژن‌های سم‌زدایی شناخته شده شناسایی شد. سپس با استفاده از الگوریتم‌های بیوانفورماتیک، تعاملات بالقوه بین این miRNA ها و ژن‌های سم‌زدایی هدف آن‌ها (pgp, gpx1a, gpx3, aldh3b1, gstm3, cyp3c1, gstp1, gpx1b, cyp17a1, sod1, sod2, gsto2, gstz1, akr7a3, gsr, ahr1b, cat, ahr2, abcb4, cyp11a1) مورد ارزیابی قرار گرفت . علاوه بر این، میزان حفاظت از تعاملات miRNA-هدف در بین گونه‌ها ارزیابی شد و مکان‌های بالقوه اتصال miRNA در مناطق ترجمه نشده 3' (UTRs) mRNAهای هدف مورد تجزیه و تحلیل قرار گرفت. یافته‌های ما روابط تنظیمی پیچیده بین miRNA ها و ژن‌های دخیل در سم‌زدایی در گورخرماهی را نشان داد. این نتایج می‌تواند به عنوان پایه‌ای برای اعتبارسنجی‌های تجربی آینده باشد و به دانش رو به رشد، تنظیم ژن با واسطه miRNA در زمینه مسیرهای سم‌زدایی در گورخرماهی کمک کند.
ارسال پیام به نویسنده مسئول
| بازنشر اطلاعات | |
 |
این مقاله تحت شرایط Creative Commons Attribution-NonCommercial 4.0 International License قابل بازنشر است. |
This work is licensed under a Creative Commons — Attribution-NonCommercial 4.0 International (CC BY-NC 4.0)